不可以。智行火车票不可以在12306直接退票，只能通过智行退票。
乘客一般通过那种渠道购票，退票也需要通过购票的渠道，比如乘客利用第三方平台智行购买火车票时，虽然第三方平台也是从12306软件进行购票服务，但是12306软件建立的订单为智行，乘客也就无法通过12306软件账号查到订单和退票，只能通过智行系统完成退票操作。
当然可以退票了。乘客在智行软件上购买的火车票，其实也是通过智行与12306软件建立链接购买的，所以在智行上购票时需要输入登录用户名和密码。因此，乘客在12306软件上也能查到订单信息，故可以在12306上退票。不过，在12306让退票后，因为退票信息未发送给智行，智行上仍显示购票成功。
